We are studying the regulatory mechanisms that govern the expression of functional RNAs in cells. Cells contain numerous RNAs that are not translated into proteins, known as non-coding RNAs. The non-coding RNAs play critical roles in regulating gene expression and are essential for biological processes such as cell differentiation, development, and oncogenesis. Dysregulation or dysfunction of non-coding RNAs has also been implicated in various diseases, including cancer.
Our laboratory focuses on RNA biogenesis factors that regulate the expression and function of non-coding RNAs, and proteins that interact with RNAs. Utilizing a multidisciplinary approach that combines molecular biology, biochemistry, genetics, and structural biology techniques (including X-ray crystallography and cryo-electron microscopy), we investigate the molecular mechanisms underlying RNA metabolism and expression. Our research has elucidated the detailed reaction and regulatory mechanisms of RNA-processing enzymes, RNA-modifying enzymes, RNA-binding proteins, and viral RNA polymerases. These findings have been published in leading scientific journals..ーー>See our publication list
We welcome students who wish to continue their studies in a doctoral program after completing a master’s degree and aim to earn a PhD. Most of our PhD students receive strong financial support through advanced human resource development initiatives, such as the SPRING GX program, which supports the Green Transformation (GX) initiative for PhD education. Most students in our laboratory have published their research achievements as the first author in internationally renowned scientific journals during their study period. Many of our students have received the CBMS Excellenr Research Award (ERA Award) for their master’s and doctoral theses, and some have received the GSFS Dean’s Award. We are looking for motivated and ambitious students who are passionate about conducting high-quality basic research on RNA biogenesis and regulation, solving unanswered scientific questions, and sharing their discoveries in top-tier journals. If you are enthusiastic about science and excited to explore new challenges, we would be delighted to work with you.
Prospective students are encouraged to reach out to us via email (contact details are available on our lab’s website) to discuss potential opportunities. We are also happy to arrange lab visits if needed.
私たちは細胞内に存在する機能性RNAの機能発現制御の詳細な分子機構を明らかにする研究を行っています。私たちの細胞にはタンパク質へ翻訳されないRNAーノンコーディングRNAーが数多く存在します。これらのRNAは多岐にわたる遺伝子の発現を制御し、細胞分化、発生、がん化などの多くの高次生命現象発現において重要な役割を果たしていることが明らかにされています。ノンコーディングRNAの機能不全や発現制御の破綻は、がんをはじめとする疾患の原因となることも報告されています。
私たちはノンコーディングRNAの発現や機能を制御するRNA生合成因子ーRNA biogenesis factorsーやRNAに作用するタンパク質に注目して研究を行なっています。RNA生合成因子による機能性RNAの代謝や機能制御の詳細な分子機構を、分子生物学、生化学、遺伝学、構造生物学手法(X線結晶構造解析、クライオ電子顕微鏡)を用いて解析を進めています。これまでノンコーディングRNAの機能や代謝を制御するRNAプロセシング酵素、RNA修飾酵素、RNA分子に作用する酵素、ウイルスRNA合成酵素などについて、これらの酵素、酵素複合体の詳細な反応分子機構、制御機構を明らかにし、その成果を世界トップレベルの雑誌に発表してきました。発表論リスト
私たちの研究室では修士課程修了後、引き続き博士課程に進学し、博士号取得を目指す学生の研究室への参画を歓迎します。博士課程学生のほとんどは博士課程学生支援グリーントランスフォーメーション(GX)を先導する高度人材育成プログラム(SPRING GX)などから十分な経済的サポートを受けています。これまで当研究室の学生は在学期間中に世界的に評価の高い雑誌に研究成果を筆頭著者として発表してきています。また、多くの学生がメディカル情報生命専攻の修士・博士論文優秀発表賞(Excellenr Research Award: ERA賞)を受賞、また新領域創成科学研究科研究科長賞などを受賞した学生もいます。RNAの生合成、機能制御に関する質の高い基礎研究に興味があり、世界で最初に未解決の問題を明らかにし、世界トップレベルの科学雑誌に研究成果を発表したい野心的な学生を歓迎します。サイエンスに没頭して、知的興奮を私たちと一緒に共有できる優秀な学生をお待ちしています。また、興味のある学生は、電子メールにてあらかじめご連絡ください(電子メール等連絡先は研究室HPを参照にしてください)。研究室訪問等随時対応いたします。
プレス発表
- [Press release] U6 snRNA特異的ウリジル化酵素によるRNA認識機構の解明 ~複数ドメインからなる酵素がU6 snRNAを抱きかかえる
- [Press release] 病原性細菌の生存競争に関わるタンパク質の活性化の分子機構を解明 ―アミノ酸生合成酵素がtRNA切断酵素の足場として機能―
- [Press release] 結核菌の増殖制御に関わるトキシンの基質特異性の分子機構解明―新規薬剤開発へ期待―
- [Press release] Pre-mRNAスプライシングの鍵となるU6 snRNAの成熟メカニズムの解明―U6 snRNA成熟異常による疾患理解へ貢献―
- [Press release] 生物の耐熱性を支える「錠前」の発見~可逆的なリン酸化修飾がRNAを安定化する~
- [Press release] 細菌の生存競争に関わるタンパク質の活性化の分子機構を解明〜翻訳因子のこれまで知られていなかった新たな機能の発見〜
- [Press release] サルモネラ菌の休眠・薬剤耐性に関与するタンパク質の機能を解明〜病原性細菌に対する新しいタイプの薬剤開発に期待〜
参考論文
Nature Communications 14 , 2023; Nature 605, 372, 2022; Cell Reports 37,110130, 2021; Nature Communications 11, 2020; Nature Communications 10, 1960, 2019; Structure 27, 476, 2019; Nature Chemical Biology 14, 2010,2018; Nature Communications 8, 15788, 2017; Structure 24, 918, 2016; Structure 23, 830, 2015; Structure 22, 315, 2014;Structure 20, 1661, 2012;Nature Structural & Molecular Biology 19, 229, 2012;Structure 19, 232, 2011;Proc Natl Acad Sci U S A. 107, 15733, 2010;EMBO J. 28, 3353, 2009;EMBO J. 27, 1944, 2008;Nature. 449,867, 2007;EMBO J. 25, 5942, 2006;Nature. 443, 956, 2006;Nature. 430, 700, 2004 ;EMBO J. 22, 5918, 2003; Cell. 111, 815, 2002; Science 294, 1334, 2001.